Kapel digunakan untuk perayaan ekaristi kelas maupun angkatan kelas untuk membentuk dan menjaga hidup rohani. Pelayanan kapel dilakukan oleh Putera-puteri Altar Loyola (PAL), oleh anggota kelas, dan oleh anggota koor (LV – Loyola Voices) di bawah pendampingan Pater Pamong.
Kapel Loyola juga dipakai untuk memberikan pelayanan rohani bagi umat di sekitar Loyola dalam ekaristi harian jam 5.45 dan juga mingguan jam 7.15.
